Le protocole de collaboration à la base de ces conventions prévoit l’organisation périodique, avec la participation de lauréats Balzan et de membres des Académies, de forums et de conférences sur les thèmes scientifiques et les matières faisant l’objet du Prix Balzan ; il prévoit également l’échange d’expériences pouvant servir à la promotion de la culture et des sciences.
Le choix des objectifs et la programmation des initiatives sont confiés à des commissions paritaires.